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  • 3月 18 週一 201914:22
  • anova各種檢定

變異數同質性檢定的方法有:
• Hartley’s F-max test (1950)
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  • 3月 18 週一 201914:17
  • Scheffe’s test

一般在作差異分析時,常用的方法為獨立樣本T檢定及單因子變異數分析(one-way ANOVA),可是這二個方法其實都有前提假設:
 
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  • 3月 15 週五 201917:18
  • 穀胱甘肽二硫化物/穀胱甘肽對的氧化還原狀態觀察細胞的氧化還原環境

氧化還原狀態是在自由基和氧化應激的研究領域中廣泛使用的術語。不幸的是,它被用作一個通用術語,指的是未明確定義或定量的相對變化。在這篇綜述中,我們提供了生物液體,細胞器,細胞或組織的氧化還原環境的定義。我們說明瞭如何用能斯特方程估算各種氧化還原對的還原電位,並說明pH和包含不同氧化還原對的物質的濃度如何影響還原電位。我們討論了穀胱甘肽二硫化物 - 穀胱甘肽偶(GSSG / 2GSH)的氧化還原狀態如何作為氧化還原環境的重要指標。細胞中有許多氧化還原對,它們共同作用以維持氧化還原環境; GSSG / 2GSH對是細胞中最豐富的氧化還原對。GSSG / 2GSH對的半細胞還原電位(E(hc))的變化似乎與細胞的生物學狀態相關:增殖E(hc)約為-240mV; 分化E(hc)約為-200mV; 或凋亡E(hc)約-170mV。這些估計可用於更全面地了解氧化應激導致的氧化還原生物化學。這些是邁向新的定量生物學的第一步,希望能夠提供與細胞生長和發育,信號傳導和還原或氧化應激相關的細胞機制的基本原理和理解。增殖E(hc)約為-240 mV; 分化E(hc)約為-200mV; 或凋亡E(hc)約-170mV。這些估計可用於更全面地了解氧化應激導致的氧化還原生物化學。這些是邁向新的定量生物學的第一步,希望能夠提供與細胞生長和發育,信號傳導和還原或氧化應激相關的細胞機制的基本原理和理解。增殖E(hc)約為-240 mV; 分化E(hc)約為-200mV; 或凋亡E(hc)約-170mV。這些估計可用於更全面地了解氧化應激導致的氧化還原生物化學。這些是邁向新的定量生物學的第一步,希望能夠提供與細胞生長和發育,信號傳導和還原或氧化應激相關的細胞機制的基本原理和理解。
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  • 3月 15 週五 201916:46
  • 能斯特方程式


能斯特方程式(Nernst,又譯:奈斯特方程式),是電化學中用來計算電極上相對於標準電位(E0)來說的指定氧化還原對的平衡電壓(E)。命名自瓦爾特·能斯特。能斯特方程式只能在氧化還原對中兩種物質同時存在時才有意義。
參考
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  • 3月 12 週二 201923:11
  • FIAM和BLM模型差別

細胞特異性生長速率和不同游離Cd或Zn離子濃度下的細胞內金屬濃度。無論是添加乙二胺四乙酸(EDTA)還是次氮基三乙酸(NTA),兩種菌株在短期(4小時)攝取實驗期間均顯示出一級攝取動力學。自由離子活動模型(FIAM)解釋了Cd或Zn的短期吸收,但未能預測Cd或Zn在兩種菌株中的長期(48小時)毒性。相反,細胞內Cd或Zn濃度更有效地解釋了兩種菌株的Cd或Zn毒性,表明生物配體模型(BLM)可用於預測銅綠微囊藻毒素的Cd或Zn毒性。
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  • 3月 12 週二 201915:44
  • 細胞和細菌差別

細胞 為"構成生物之最小單位"*(國一老師教) 
細胞(英文:Cell)是一切生命活動的基本結構和功能單位。它是除了病毒之外所有具有完整生命力的生物的最小單位,也經常被稱為生命的積木(病毒僅由DNA/RNA組成,並由蛋白質和脂肪包裹其外)。細胞可分為截然不同的兩大類:原核細胞和真核細胞。細菌界和古菌界的生物由原核細胞構成。原生生物,真菌,植物和動物均由真核細胞構成。 
生物可分為單細胞生物(僅由單個細胞構成,包括大多數的細菌)和多細胞生物(包括植物和動物)。人體約包含60兆個細胞。植物細胞和動物細胞的大小在1μm到100μm之間,所以在顯微鏡下可見。 
細胞由羅伯特·虎克於1665年發現。細胞學說最早由馬蒂亞斯·雅各布·施萊登和泰奧多爾·施旺提出。現代細胞理論的內容包括:所有生物均由一個或多個細胞組成,細胞由原已存在的細胞分裂而來,生物最重要的功能在細胞內完成,所有細胞均包含有控制功能和傳遞繁殖信息所必須的遺傳物質。 細胞(cell)一詞來源於拉丁語cella,意為「狹窄的房間」。羅伯特·虎克最先使用該詞作為描述性術語來表述「最小的生物組成結構」,在他1665年出版的書中他把通過顯微鏡所看到的軟木塞細胞與僧侶所居住的小房間來比較。細胞生物學,舊稱細胞學是研究細胞的形態結構、生理機能、發育、生活史,以及各種胞器及訊息傳遞路徑的學科,可根據研究的尺度來分類,包括顯微水平,超微水平和分子水平等不同層次研究細胞的結構、功能及生命活動。 
細菌 為生物之一 
細菌(Bacteria,單數型:Bacterium)是生物的主要類群之一,屬於細菌域。細菌是所有生物中數量最多的一類,據估計,其總數約有 5×1030個。細菌的個體非常小,目前已知最小的細菌只有0.2微米長 ,因此大多只能在顯微鏡下看到它們。細菌一般是單細胞,細胞結構簡單,缺乏細胞核、細胞骨架以及膜狀胞器,例如粒線體和葉綠體。基於這些特徵,細菌屬於原核生物(Prokaryota)。原核生物中還有另一類生物稱做古細菌(Archaea),是科學家依據演化關係而另闢的類別。為了區別,本類生物也被稱做真細菌(Eubacteria)。 
細菌廣泛分佈於土壤和水中,或著與其他生物共生。人體身上也帶有相當多的細菌。據估計,人體內及表皮上的細菌細胞總數約是人體細胞總數的十倍。此外,也有部分種類分布在極端的環境中,例如溫泉,甚至是放射性廢棄物中,它們被歸類為嗜極生物,其中最著名的種類之一是海棲熱袍菌(Thermotoga maritima),科學家是在義大利的一座海底火山中發現這種細菌的。然而,細菌的種類是如此之多,科學家研究過並命名的種類只佔其中的小部份。細菌域下所有門中,只有約一半能在實驗室培養的種類。 
細菌的營養方式有自養及異養,其中異養的腐生細菌是生態系統中重要的分解者,使碳循環能順利進行。部分細菌會進行固氮作用,使氮元素得以轉換為生物能利用的形式。細菌也對人類活動有很大的影響。一方面,細菌是許多疾病的病原體,包括肺結核、淋病、炭疽病、梅毒、鼠疫、砂眼等疾病都是由細菌所引發。然而,人類也時常利用細菌,例如乳酪及酸奶和酒釀的製作、部分抗生素的製造、廢水的處理等,都與細菌有關。在生物科技領域中,細菌有也著廣泛的運用。
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  • 3月 08 週五 201923:29
  • 量測AEC

腺苷酸能量電荷(AEC)
將培養物連續稀釋並沉積在0.45μm上
膜過濾器通過抽吸,然後暴露於各種
治療方式。預熱的沸騰緩衝溶液
(50mM Tricine,10mM MgSO4和2mM EDTA at
將pH 7.8)加入到樣品中,混合物為
加熱3分鐘。將煮沸的提取物在冰上冷卻
至少10分鐘並保持在室溫下。
為了測量ATP,將提取物加入到反應緩衝液中
(75mM Tricine,pH7.5; 5mM MgCl 2和0.0125mM
氯化鉀)。為了測量ADP + ATP,添加提取物
加入0.5mM磷酸烯醇丙酮酸鹽的相同反應緩衝液
(Sigma)和0.4μg/μl的丙酮酸激酶
(Sigma)中。通過測量AMP + ADP + ATP
進一步添加0.5μg/μl的腺苷酸(myo)激酶
(Sigma)到緩衝區。 ATP和ADP + ATP混合物
在30℃下孵育30分鐘,和AMP
+ ADP + ATP混合物在37℃溫育90分鐘
30°C,全部放入沸水浴中
3分鐘停止反應,在冰上冷卻並保持在
室內溫度。然後用熒光素/確定ATP /
熒光素酶使用熒光素酶檢測試劑(Promega)
和SpectraMax L發光計(Molecular Devices)。
按照Atkinson [(ATP)+所述計算AEC
0.5(ADP)] / [(ATP)+(ADP)+(AMP)]。[1]
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  • 3月 08 週五 201912:29
  • adenylate energy charge 指標


腺苷酸能量電荷,[(三磷酸腺苷)+ 1/2(二磷酸腺苷)] / [(三磷酸腺苷)+(二磷酸腺苷)+(腺苷一磷酸)]在大腸桿菌中的價值生長期間的細胞約為0.8。在生長停止後的穩定期或碳限制培養物中的飢餓期間,能量電荷緩慢下降至約0.5的值,然後更快地下降。在能量電荷緩慢下降期間,所有細胞都能夠形成集落,但生存能力的快速下降與能量電荷的急劇下降同時發生。這些結果表明,生長只能在能量電荷值高於約0.8時發生,生存力保持在0.8和0.5之間,並且細胞死亡的值低於0.5。先前報導的各種生物和組織的腺苷酸濃度列表支持基於體外酶動力學觀察的預測,即在各種類型的完整代謝細胞中能量電荷穩定在0.85附近。
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  • 3月 07 週四 201918:34
  • Cadmium Toxicity in Glutathione Mutants of Escherichia coli

Cd 2+對硫化合物的親和力高於對氮和氧的親和力,因此理論上認為鎘的毒性應主要來自Cd 2+與硫化物,硫醇基和富含硫的絡合物而不是Cd 2的結合。 +用富氮或富氧生物化合物代替過渡金屬陽離子。通過使用大腸桿菌對合成穀胱甘肽(GSH;野生型),γ-谷氨酰半胱氨酸(ΔgshB突變體)或兩種細胞硫醇(ΔgshA)的細胞進行全球轉錄組分析來測試該假設。突變體)。使用KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)直系統系統對所得數據(其中一些通過定量逆轉錄-PCR驗證)進行分類,該系統根據各自產物的細胞功能對基因進行分級分組。三種菌株之間的主要差異涉及色氨酸生物合成,其在鎘休克時在野生型細胞中上調並且在ΔgshA細胞中強烈上調,但在含有γ-谷氨酰半胱氨酸而非GSH的ΔgshB細胞中被抑制。然而,總體而言,所有三種大腸桿菌菌株同樣對鎘休克有反應,其中蛋白質,二硫鍵和氧化損傷修復基因的上調; 半胱氨酸和鐵硫簇生物合成; 含有敏感鐵硫簇的蛋白質的生產; 鐵的儲存; 通過外排使Cd 2+解毒。一般的節能途徑和鐵攝取量下調。這些發現表明,Cd 2+的毒性作用確實是金屬陽離子與硫結合的結果
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  • 3月 05 週二 201920:12
  • 離子活度


化學中,活度(Activity)即某物質的“有效濃度”,或者稱為物質的“有效莫爾分率”。此概念由吉爾伯特·牛頓·路易斯首先提出
離子活度(α)和濃度(c)之間存在定量的關係,其表達式為:αi=γici式中:αi為第i種離子的活度;γi為i種離子的活度係數;ci為i種離子的濃度。γi通常小於1,在溶液無限稀時離子間相互作用趨於零,此時活度係數趨於1,活度等於溶液的實際濃度。
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